المستخلص
فايروس كورونا المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة 2 (SARS-CoV-2) هو المسؤول عن جائحة COVID-19. انه سلالة جديدة من فايروس كورونا تم التعرف عليه لأول مرة في ووهان، الصين، في عام 2019. وأعلنت منظمة الصحة العالمية (WHO) ان تفشي COVID-19 أصبح وباءً في 11 مارس 2020، وهو مستمر في الانتشار. أدى استمرار ظهور المتحورات وانتشارها على الصعيد العالمي إلى الملايين من حالات الإصابة المؤكدة والوفيات، لا سيما لدى كبار السن أو الأشخاص الذين لديهم ظروف صحية معينة. الغرض من بناء شجرة النشوء والتطور هو استنتاج العلاقات التطورية، وكيف ومتى اختلفت الأصناف عن سلفها المشترك، لتحديد الكائنات الحية الأكثر ارتباطًا ببعضها البعض وفهم أنماط وعمليات الانتواع بين الكائنات الحية المختلفة بناءً على مقارنة خصائصها الجينية. يمكن استخدام الشجرة لفهم التاريخ التطوري لمجموعات مختلفة من الكائنات الحية ويمكن أيضًا استخدامها لعمل تنبؤات حول العلاقات بين الأنواع المختلفة. علاوة على ذلك، يمكن أن يساعد بناء شجرة النشوء والتطور في تحديد الأحداث التطورية الرئيسية، مثل معرفة أصل ظهور السمات او السلالات جديدة. في هذه الرسالة، تم اقتراح شجرة نشوء وتطور مدعومة جيداَ وجديرة بالثقة بالحصول على اعلى قيمة تمهيدية لجميع عقد الأشجار عند تطبيق خوارزميات مختلفة لكل جنس من اجناس الفيروسات التاجية باستخدام خوارزمية الاحتمالية القصوى (ML)، خوارزمية ربط الجوار (NJ)، وخوارزمية الحد الأقصى من البخل (MP). حيث تم الحصول على اعلى قيمة تمهيدية بناءً على خوارزمية الاحتمالية القصوى. أظهرت النتائج النهائية لتحليل شجرة النشوء والتطور ان تسلسلات كَاما كورونا فايروس وSARS-CoV-2 كان لهما معدل اعلى من SNPs وINDELs مقارنة بالتسلسلات من أجناس فيروس كورونا الأخرى.
